UMLS数据解读

什么是UMLS

UMLS（Unified Medical Language System，同一医学语言体系），简朴来说就是将差异的医学标准同一到一套体系的体系，重要为了医疗体系的同一而构建出的。
UMLS的重要构成部分

• Metathesaurus：一个包罗多个医学术语体系的元数据库，旨在同一和映射差异泉源的医学概念。
  
• Semantic Network：一个包罗语义分类和关系的网络。它可以资助用户辨认概念之间的语义关系。
  
• SPECIALIST Lexicon and Lexical Tools：专业词库与词汇工具。
  

UMLS Metathesaurus元数据库

Metathesaurus 的重要作用是未来自 差异医疗术语体系（如 SNOMED CT、MeSH、ICD-10、LOINC 等）的术语举行标准化和关联，以便实现医学信息的互使用性。
web页面：UMLS Metathesaurus Browser
每个 医学概念 在 Metathesaurus 中都被分配一个 CUI（Concept Unique Identifier）。差异术语（term）体系中的同义术语会被映射到雷同的 CUI。别的Metathesaurus里还记载了一些关系范例。

表名	作用
MRCONSO	术语表，包罗全部概念的差异名称和泉源
MRSTY	语义范例表，给出每个 CUI 的语义分类
MRREL	关系表，体现 CUI 之间的关系（犹如义、上下位等）
MRDEF	概念界说表，包罗医学概念的界说
MRSAT	属性表，提供额外的概念属性信息

UMLS Semantic Network语义网络

重要记载了差异语义范例及语义关系。web页面：UMLS Metathesaurus Browser
语义范例（semantic type）

用于对 UMLS 概念举行分类。比方：

• Disease or Syndrome（疾病或综合征）
  
• Pharmacologic Substance（药理物质）
  
• Body Part, Organ, or Organ Component（身材部位、器官或器官构成部分）
  
• Diagnostic Procedure（诊断步伐）
  
• ...
  

每个 UMLS 概念（Concept Unique Identifier, CUI）至少属于一个语义范例。
语义关系（Semantic Relations）

• 语义网络界说了一组有限的 语义关系，用于形貌语义范例之间的关系。比方：
  
  
  
  • isa（是）：体现一种条理关系，如“心脏（Heart） isa 身材部位（Body Part）”。
    
  • part_of（属于）：体现部分-团体关系，如“心脏（Heart） part_of 心血管体系（Cardiovascular System）”。
    
  • treats（治疗）：如“阿司匹林（Aspirin） treats 心脏病（Heart Disease）”。
    
  • causes（导致）：如“病毒（Virus） causes 感染（Infection）”。
    
  • ...
    
  
  

UMLS关键ID寄义解说

CUI，LUI，SUI，AUI差异如下图。简朴来说末了都会被映射成CUI。其他细节信息可以参考Ref3，4。

干系字段的关系

UMLS数据缩写及字段寄义详解

其他具体的表及字段内里的缩写种别寄义可以参考reference2

REFERENCE

Unified Medical Language System (UMLS)
2024AB Release Documentation
UMLS - Frequently Asked Questions
UMLS Quick Start Guide