MR|孟德尔随机化常用的GWAS数据库

当我们明白了研究假设、订定完孟德尔随机化（MR）分析筹划后，就要开始举行数据分析。众所周知，MR分析依赖于GWAS数据，GWAS数据包罗两种：（1）单个队列的GWAS结果；（2）多个队列GWAS的meta分析。因此，本日将简单先容几个常用的GWAS数据的数据库。



GWAS Catalog数据库：https://www.ebi.ac.uk/gwas/

GWAS Catalog（全称：Genome-Wide Association Study Catalog）是一个存储基因组范围关联研究（GWAS）结果的数据库。网络、整理和提供了各种研究中发现的基因-表型关联数据。其是EMBL-EBI旗下的一个数据库，收录了比力全的公开辟表的GWAS分析结果。
该数据库提供了以下信息：关联的基因和基因变异、关联疾病或表型特性、关联研究的文献引用和出书物关联的遗传变异的基因组位置、关联效应巨细和统计学显着性。

常用的有以下3个模块：
1. Search
可以根据以下多种条件举行检索
发表论文
遗传位点
表型，性状
基因
染色体上某个地区
2. Diagram：以疾病为单元举行检索，检察每种疾病全部相干SNP位点的结果，结果展示了全部关联的SNP位点在染色体上的分布
3. 下载：下载关联分析的结果，提供了多种格式的结果供下载


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