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专栏十七:怎样选择你的单细胞亚群的分辨率--chooseR ...
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专栏十七:怎样选择你的单细胞亚群的分辨率--chooseR
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发表于 2026-2-5 23:22:38
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好久没更,没想到还是有小同伴订阅,那就更一个近来看到的标题
1.缘起
是由于在文章Single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics reveal cancer-associated fibroblasts in glioblastoma with protumoral effects(https://doi.org/10.1172/JCI147087.)中看到
也就是说这里的细胞分群resolution是有stability score的结果决定的,返归去看图
可以看到这里有一个reslution=0.3的稳固性最高
看一下sup figure,实际上作者在调解res=0.3以后,依然将细胞群举行了归并,也就是说这个所谓的"stability score"得到的分群结果要更为具体,仍旧必要手动举行细
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